sedを使って空白行と行頭・末尾の空白を削除して行頭・行末に文字列を追加する

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$ cat hoge.txt | sed -e 's/^ *//' 行頭のスペースを削除する
$ cat hoge.txt | sed -e 's/ *$//' 行末のスペースを削除する
$ cat hoge.txt | sed -e '/^ *$/d'  空白行（何も書かれていない行）を削除
$ cat hoge.txt | sed -e 's/^/
/g' 行頭に「
」を追加
$ cat hoge.txt | sed -e 's/$/<\/li>/g' 行末に「
」を追加

パイプでつないで

cat hoge.txt | sed -e 's/^ *//' | sed -e 's/ *$//'| sed -e '/^ *$/d'| sed -e 's/^/
/g'| sed -e 's/$/<\/li>/g' > hoge2.txt

とりあえず、処理をしたい時は何も考えず指の動くまま作業をしてしまいます。 ^^;